Vos questions sur l’ADN et la génomique appliquée.

L’ADN environnemental désigne les traces d’ADN que les organismes laissent dans leur milieu : cellules, mucus, excréments ou gamètes. Prélevées dans l’eau, les sols, les sédiments ou les biofilms, ces traces permettent d’identifier les espèces présentes sans les capturer ni les observer directement.

Non. L’ADNe révèle la présence d’ADN d’une espèce dans un échantillon ; il complète les inventaires naturalistes et l’expertise écologique sans les remplacer, et n’indique pas directement l’effectif d’une population.

Le métabarcoding recherche plusieurs espèces à partir de marqueurs génétiques partagés par les groupes ciblés (12S, COI, 18S, ITS…). La PCR digitale (dPCR) détecte et quantifie des séquences d’ADN ciblées. Nos tests d’espèces utilisent des amorces et une sonde spécifiques ; des analyses multiplex peuvent rechercher plusieurs cibles lorsque le protocole le permet.

Non. La dPCR estime une quantité d’ADN cible, en nombre de copies. Cette mesure aide à comparer des échantillons ou des sites, mais ne compte pas directement les individus présents.

L’eau de mer et l’eau douce, les sols, les sédiments et les biofilms. LDgenX propose des kits d’échantillonnage adaptés à chaque milieu, y compris pour l’air.

Non. LDgenX intervient sur une étude complète, une étape d’analyse ou un développement spécifique. Le premier échange peut avoir lieu avant la campagne de terrain pour construire ensemble la stratégie d’échantillonnage.

LDgenX dispose d’amorces et de sondes pour 22 espèces (mammifères, poissons, reptile et invertébrés) et conçoit des tests sur mesure pour de nouvelles cibles. Les matrices, les conditions d’utilisation et les performances sont évaluées selon le projet.

Oui. L’accompagnement bioinformatique couvre le traitement, l’analyse et l’interprétation de données existantes : métabarcoding, métagénomique, WGS, RADseq, RNAseq ou épigénétique.

Oui. LDgenX prépare des kits d’échantillonnage selon le milieu (eau de mer, eau douce, sol, air) et propose du matériel de filtration de l’eau : pompe triple, stick pump et torpille. Leur composition se précise avec l’équipe selon votre protocole.

LDgenX apporte des données ADN aux états initiaux, aux études d’impact et aux suivis, en appui des bureaux d’études et des maîtres d’ouvrage : stratégie d’échantillonnage, analyses et interprétation. Le dossier réglementaire et la définition des mesures relèvent du maître d’ouvrage.

LDgenX est agréée au titre du crédit d’impôt recherche (CIR). Les travaux de R&D éligibles que vous lui confiez peuvent entrer dans l’assiette de votre CIR, sous réserve des conditions applicables à votre entreprise et au projet. L’agrément du prestataire ne rend pas automatiquement toute prestation éligible.

Le périmètre de la prestation, les modalités de restitution, le calendrier et le devis se précisent à partir de votre besoin, au cadrage du projet. Plus votre demande est précise, plus la proposition l’est aussi.

L’équipe est implantée à la station Ifremer de Palavas-les-Flots, près de Montpellier (Hérault, Occitanie). Ses études couvrent aussi d’autres régions, comme les ports et estuaires d’Artois-Picardie.

Dr Maeva Leitwein et Dr Emilie Delpuech, cofondatrices, spécialisées en génomique des populations et en bioinformatique ; Maxime Lambert, ingénieur laboratoire en biologie moléculaire ; Dr Damien Crestel, bioinformaticien en génétique des populations et quantitative.

Oui. Ils cosignent des articles dans des revues scientifiques à comité de lecture, comme Molecular Ecology, Genetics Selection Evolution, Heredity ou Evolutionary Applications. Chaque article est présenté avec sa synthèse sur la page Recherche.