ADN environnemental
Révéler la biodiversité, à partir de ses traces.
L’ADN environnemental (ADNe) permet d’étudier les espèces à partir des traces d’ADN présentes dans l’eau, les sols, les sédiments ou les biofilms. LDgenX accompagne vos projets de surveillance, de conservation et d’étude d’impact.
Votre besoin scientifique
Une question, un milieu, des espèces à connaître.
Vous cherchez à inventorier un milieu, suivre une espèce ou éclairer une décision de gestion ? L’approche se construit à partir de votre question, du milieu étudié et des groupes biologiques qui vous intéressent.
Les approches à mobiliser
Quatre façons de lire les traces d’ADN.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Métabarcoding
Inventaire de la biodiversité à partir de marqueurs génétiques ciblés (12S, COI, 18S, ITS…).
Métagénomique
Analyse globale des communautés biologiques.
dPCR ciblée
Détection et quantification de l’ADN d’espèces ou de pathogènes ciblés grâce à la PCR digitale.
Séquençage longue lecture
Résolution taxonomique améliorée et nouvelles perspectives d’analyse.
Nos prestations
Du protocole au rapport d’aide à la décision.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Conception du projet
- Conception d’amorces (si nécessaire)
- Extraction d’ADN
- Séquençage
- Analyses bioinformatiques
- Analyses statistiques
- Analyses de diversité
- Rapport d’aide à la décision
- PCR digitale (dPCR)
- Cartographie et visualisation
Champs d’application
Là où l’ADNe apporte une réponse.
- Inventaires de biodiversité
- Études d’impact
- Espèces invasives
- Espèces protégées
Cas d’études
Des milieux déjà explorés.
État des lieux de la biodiversité marine sur le site pilote
Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
De l’échantillonnage à la bioinformatique, les analyses sont reliées à votre objectif. La restitution et le niveau d’accompagnement sont définis avec l’équipe scientifique au cadrage du projet.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Expertises complémentaires
Aller plus loin, ensemble.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr