Bioinformatique
Des données complexes. Une question qui guide l’analyse.
LDgenX propose un accompagnement bioinformatique pour les projets de recherche, de biodiversité et d’innovation. Le traitement, l’analyse et l’interprétation sont construits autour de votre problématique biologique.
Votre besoin scientifique
Des données brutes à la réponse biologique.
Des données de séquençage ne répondent pas seules à une question scientifique. Le choix des analyses et la compréhension du contexte sont essentiels pour en tirer une information exploitable.
Les approches à mobiliser
À chaque type de données, son analyse.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Diversité et communautés
Analyse de données de métabarcoding et de métagénomique.
Génomique
Analyse de données WGS, RADseq et séquençage longue lecture.
Expression et épigénétique
Accompagnement des analyses RNAseq et épigénétiques.
Pipelines et GWAS
Développement de pipelines spécifiques et analyses d’associations génétiques.
Nos prestations
De la qualité des données à leur restitution.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Contrôle qualité
- Développement de pipelines
- Analyses statistiques
- Analyses de diversité
- Cartographie et visualisation
- Reproductibilité des analyses
- Bancarisation des données
- Accompagnement scientifique
Champs d’application
Les données que nous analysons.
- Métabarcoding et métagénomique
- RADseq, RNAseq
- WGS
- Épigénétique
- GWAS
Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
Notre équipe met en relation les analyses informatiques et les questions du vivant. Le périmètre, les données d’entrée et les modalités de restitution sont précisés ensemble.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Expertises complémentaires
Aller plus loin, ensemble.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr