Séquençage & dPCR
La technologie adaptée à votre question scientifique.
Séquençage d’amplicons, longues lectures, génomes entiers ou détection d’espèces par dPCR : LDgenX accompagne vos projets, de la conception d’amorces et de sondes spécifiques à l’interprétation des résultats, y compris la quantification d’ADN environnemental d’une espèce cible.
Votre besoin scientifique
Lire des génomes ou détecter une espèce ?
Séquençage d’amplicons, longues lectures ou détection ciblée : le choix de la technologie doit être relié aux échantillons et à l’information que vous cherchez à obtenir.
Les approches à mobiliser
Des amplicons aux génomes entiers.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Séquençage d’amplicons
16S, ITS, COI, 12S, 18S et marqueurs personnalisés.
Métagénomique
Analyse taxonomique et fonctionnelle des communautés biologiques.
Génome complet · WGS
Séquençage visant l’ensemble du génome, avec une couverture adaptée au projet.
RADseq et panels SNP
Analyses de génomique des populations.
Séquençage longue lecture
Oxford Nanopore.
dPCR
Détection et quantification de l’ADN d’une espèce cible, avec des amorces et une sonde spécifiques.
Nos prestations
De l’extraction à la PCR digitale.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Extraction d’ADN
- Préparation des banques de séquençage
- Séquençage
- Conception d’amorces (si nécessaire)
- PCR digitale (dPCR)
- Accompagnement scientifique
Champs d’application
Ce que nous séquençons et détectons.
- Séquençage d’amplicons
- Séquençage courts et longs fragments
- Génomes entiers et partiels
- Détection d’espèces cibles ou de variants
Cas d’études
Des cibles déjà étudiées.
Épigénétique du sar
Détection d’espèces méditerranéennes emblématiques par dPCR
Détection de l’oursin violet (Paracentrotus lividus)Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
L’accompagnement peut relier la biologie moléculaire, le séquençage et la bioinformatique. L’approche et la restitution sont définies à partir de vos objectifs.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Un éclairage concret
Les communautés microbiennes des microplastiques.
Le séquençage des communautés microbiennes qui colonisent les microplastiques.
Explorer cette étudeEn bref
- Rôle de LDgenX
- Séquençage
- Supports
- Microplastiques
- Domaine
- Microbiologie environnementale
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Expertises complémentaires
Aller plus loin, ensemble.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr