Tests ADN ciblés
Votre espèce cible, un test ADN sur mesure.
Vison d’Europe, thon rouge, requins, tortue caouanne : LDgenX dispose d’amorces et de sondes pour 22 espèces et conçoit des tests pour de nouvelles cibles. La PCR digitale (dPCR) détecte et quantifie l’ADN de l’espèce recherchée dans l’eau, les sols ou les sédiments.
Votre besoin scientifique
Une question, une espèce.
Une espèce protégée à confirmer, une espèce invasive à détecter tôt, un pathogène à surveiller ? Quand la question porte sur une espèce précise, un test ciblé y répond plus directement qu’un inventaire.
Amorces et sondes en interne
22 espèces, prêtes à être recherchées.
22 espèces, prêtes à être recherchées.
Mammifères, poissons, reptile et invertébrés : LDgenX dispose d’amorces et de sondes pour chacune de ces espèces. Choisissez-en une pour voir le détail.
Mammifères 6
Poissons 13
- Thon rougeThunnus thynnus
- EspadonXiphias gladius
- Petit marlin de MéditerranéeTetrapturus belone
- Requin peau bleuePrionace glauca
- Requin makoIsurus oxyrinchus
- Requin taupe communLamna nasus
- Requin renard communAlopias vulpinus
- Raie pastenague violettePteroplatytrygon violacea
- Thon germonThunnus alalunga
- Poisson luneMola mola
- Requin pèlerinCetorhinus maximus
- Grand requin blancCarcharodon carcharias
- Requin renard à gros yeuxAlopias superciliosus
Reptiles 1
Votre espèce n’y figure pas ?
Nous concevons des tests pour de nouvelles cibles.
Discuter de votre testLes approches à mobiliser
Détecter, quantifier, surveiller.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Détecter une espèce
Savoir si l’ADN d’une espèce précise est présent dans un échantillon d’eau, de sol ou de sédiment.
Quantifier son ADN
Estimer la quantité d’ADN cible, en nombre de copies, pour comparer des échantillons ou des sites.
Espèces rares ou invasives
Rechercher une espèce protégée, menacée ou invasive, lorsque la question porte sur une cible précise.
Pathogènes
Surveiller un pathogène par dPCR, par exemple dans les filières aquacoles.
Votre espèce cible, un test ADN sur mesure
Nos espèces cibles
Mammifères
Vison d’Europe
Mustela lutreolaAmorces et sondes en interne
LDgenX dispose d’amorces et de sondes pour cette espèce. Décrivez-nous votre projet pour définir ensemble l’approche adaptée.
Les matrices, les conditions d’utilisation et les performances du test sont évaluées selon le projet.
Parler de cette cibleLes étapes du développement d’un test
Préciser l’espèce, la question posée et les espèces proches à ne pas confondre, à partir des séquences de référence disponibles.
La dPCR estime une quantité d’ADN cible, en nombre de copies ; elle ne compte pas directement les individus présents.
Votre espèce n’est pas dans la liste ?
Présentez-nous l’espèce, votre question et vos échantillons : nous étudions avec vous le développement d’un test adapté.
Nos prestations
De la conception au rapport.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Conception d’amorces et de sondes
- Évaluation de la spécificité
- Extraction d’ADN
- PCR digitale (dPCR)
- Interprétation des résultats
- Rapport d’aide à la décision
Champs d’application
Les cibles les plus fréquentes.
- Espèces protégées
- Espèces invasives
- Espèces d’intérêt halieutique
- Pathogènes
Cas d’études
Des cibles déjà étudiées.
Détection d’espèces méditerranéennes emblématiques par dPCR
Détection de l’oursin violet (Paracentrotus lividus)Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
Chaque test se définit avec vous : l’espèce, les espèces proches à ne pas confondre, les matrices et le plan d’échantillonnage. Les performances du test sont évaluées selon le projet.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr