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La génomique en pratique

Des questions concrètes. Des approches scientifiques.

Des ports d’Artois-Picardie aux parcs éoliens en mer : des questions de terrain, et la façon dont nous y répondons.

Les études

Nos études de cas

ADN environnemental

Lire la biodiversité des ports et des estuaires.

La questionComment améliorer la connaissance de l’ichtyofaune et comparer l’ADNe aux méthodes classiques d’acquisition de données ?CommanditaireAgence de l’eau Artois-PicardieRéalisationGroupement Qualyse, LDgenX et PrelevmarMilieuxPorts et estuaires de la façade maritimeApprocheADN environnemental sur prélèvements d’eauVoir l’étude
Génomique des populations

D’où viennent les vanneaux huppés qui hivernent en France ?

La questionD’où viennent les vanneaux huppés qui hivernent en France, et leurs populations sont-elles génétiquement structurées ?CommanditaireFédération nationale des chasseursProjetVanConnect, Écocontribution n° 1274, action 1EspèceVanneau huppé, Vanellus vanellusApprocheGénotypage par séquençage (3D-GBS), 40 746 SNPPériode2024-2025Voir l’étude
Génomique des populations

Quel avenir génétique pour l’ours des Pyrénées ?

La questionQuel est l’état génétique de la population, et quels apports d’ours limiteraient la consanguinité d’ici 2050 ?CommanditaireAssociation Pays de l’Ours – ADETPartenaire scientifiqueUMR BIOGECO (INRAE, Université de Bordeaux)EspèceOurs brun, Ursus arctosDonnéesSuivi de la population, de 1975 à 2024ApprocheModélisation démo-génétique, projections jusqu’en 2050Année2025Voir l’étude
ADN environnemental

Lire l’ADN des poissons dans les eaux turbides.

La questionQuels dispositifs et quelles tailles de filtre conviennent selon la turbidité, et quels poissons détecte-t-on ?CommanditaireThibault DindartProjetADNe Estuaire, projet piloteSitesBègles, Cadillac et Le Verdon (Gironde)TurbiditéDe 14 à plus de 800 NTUÉchantillons43, analysés en doubleApprocheMétabarcoding ADNe, marqueur 12S des poissonsPériodeCampagne d’octobreVoir l’étude
Biodiversité marine

Explorer la biodiversité des parcs éoliens offshore.

La questionComment documenter la biodiversité marine dans le contexte des projets d’énergies renouvelables ?StatutÉtude en coursContexteParcs éoliens offshoreMilieuBiodiversité marineApprocheADN environnementalVoir l’étude
Microbiologie

Les communautés microbiennes des microplastiques.

La questionQuelles communautés microbiennes caractériser sur ces supports ?Rôle de LDgenXSéquençageSupportsMicroplastiquesDomaineMicrobiologie environnementaleVoir l’étude

Travaux scientifiques

Les travaux de l’équipe.

Des recherches publiées par les membres de l’équipe, avec leurs figures et leurs références.

Toutes les publications

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