Communautés microbiennes
Un monde invisible. Une diversité à comprendre.
LDgenX accompagne l’étude des communautés bactériennes, fongiques et microbiennes. Le séquençage et la bioinformatique permettent de caractériser ces communautés dans vos échantillons.
Votre besoin scientifique
Qui compose la communauté ?
La composition d’un microbiome constitue une question scientifique à part entière. Le choix de l’approche dépend des organismes étudiés, de la matrice et du niveau de caractérisation recherché.
Les approches à mobiliser
Bactéries, champignons, fonctions.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Séquençage 16S
Caractériser les communautés bactériennes.
Séquençage ITS
Étudier les communautés fongiques.
Métabarcoding microbien
Explorer la diversité microbienne au moyen de marqueurs ciblés.
Métagénomique
Approfondir la caractérisation taxonomique et fonctionnelle des communautés.
Nos prestations
De l’extraction à l’interprétation.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Extraction d’ADN
- Préparation des banques de séquençage
- Séquençage
- Analyses bioinformatiques
- Analyses statistiques
- Rapport d’aide à la décision
Champs d’application
Des eaux aux sols, des élevages à la recherche.
- Qualité des eaux
- Sols agricoles
- Aquaculture
- Recherche
Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
L’équipe accompagne la préparation du projet, les analyses moléculaires et l’interprétation bioinformatique. La question biologique reste au centre de la lecture des données.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr