Génomique des populations
Comprendre les populations. Éclairer leur avenir.
La génomique des populations apporte un éclairage sur la diversité génétique, la structure, la connectivité et l’adaptation. LDgenX développe des approches adaptées aux enjeux de conservation et de gestion des populations.
Votre besoin scientifique
Diversité, structure, connectivité.
Comment les populations se différencient-elles ? Quels échanges les relient ? Comment étudier leur diversité ? Votre question de gestion ou de recherche détermine le choix des outils génomiques.
Les approches à mobiliser
Du panel SNP au génome entier.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Génome partiel · 3D-GBS
Génotypage de milliers de marqueurs répartis sur l’ensemble du génome pour étudier la diversité génétique, la structure des populations et la connectivité.
Génome entier · WGS
Séquençage à l’échelle du génome pour rechercher des variants et étudier l’adaptation et l’histoire évolutive.
Panels SNP
Développement de panels SNP sur mesure pour le suivi génétique, l’assignation d’individus, les tests de parenté et les programmes de conservation.
Marqueurs génétiques
Identification de SNP, d’indels et d’autres variants génétiques adaptés aux objectifs de votre projet.
Nos prestations
De l’échantillon aux marqueurs génétiques.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Extraction d’ADN
- Préparation des banques de séquençage
- Séquençage
- Analyses bioinformatiques
- Découverte de marqueurs génétiques (SNP, indel)
- Rapport d’aide à la décision
- Analyses génétiques (GWAS)
- Accompagnement scientifique
- Conception du projet
Champs d’application
Des données génétiques pour gérer les populations.
- Conservation
- Gestion des populations
- Plans nationaux d’action
- Consanguinité, hybridation, origine des individus
Cas d’études
Des populations déjà étudiées.
Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
L’interprétation associe les données génétiques au contexte des populations étudiées. Les questions biologiques, les échantillons disponibles et les informations de terrain servent de fil conducteur.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr