Sélection génomique
L’information génétique au service de la sélection.
LDgenX développe des outils pour intégrer les données génétiques dans les programmes de sélection. L’accompagnement concerne notamment les filières aquacoles et agricoles.
Votre besoin scientifique
Un caractère, un programme, des données.
Vous souhaitez étudier un caractère d’intérêt, concevoir un panel de marqueurs ou structurer un programme de sélection ? La démarche doit articuler la question biologique, les données génétiques et les données phénotypiques disponibles.
Les approches à mobiliser
Des marqueurs aux modèles de sélection.
Le choix des méthodes est guidé par l’objectif scientifique et le contexte de votre projet.
Panels SNP
Développer des outils de génotypage en lien avec les objectifs de sélection.
WGS
Mobiliser le séquençage de génome entier pour l’étude des variants.
GWAS
Étudier les associations entre marqueurs génétiques et caractères d’intérêt.
Modèles de sélection
Analyser les données génétiques et phénotypiques dans le cadre de programmes de sélection.
Nos prestations
Des outils pour vos programmes.
Les étapes que l’équipe réalise pour vous, selon le périmètre de votre projet.
- Découverte de marqueurs génétiques (SNP, indel)
- Développement de panels SNP
- Analyses génétiques (GWAS)
- Modèles de prédiction génomique (BLUP)
Champs d’application
Les caractères qui comptent pour vos filières.
- Croissance
- Résistance aux maladies
- Robustesse
- Sélection assistée par marqueurs
- Développement variétal
Votre projet en pratique
Un cadrage partagé. Une proposition adaptée.
La construction du projet tient compte des données disponibles et des objectifs de la filière. Les outils et les analyses sont discutés avec votre équipe avant leur mise en œuvre.
Pour préparer le premier échange
- Votre objectif et la décision qu’il doit éclairer
- Le contexte : site, milieu, espèces ou population étudiée
- Les échantillons ou les données déjà disponibles
- Votre calendrier et vos contraintes de terrain
Ce que nous définissons ensemble
- Le périmètre de la prestation
- La stratégie d’échantillonnage et les analyses
- Les modalités de restitution
- Le calendrier et le devis
Vos secteurs d’application
La génomique sur votre terrain.
Parlons de votre projet
Votre question. Notre prochain point de départ.
Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.
Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr