Genome Biology and Evolution · 2022
Strong Parallel Differential Gene Expression Induced by Hatchery Rearing Weakly Associated with Methylation Signals in Adult Coho Salmon (O. kisutch)
Chez des saumons coho adultes issus de deux rivières, les auteurs comparent expression des gènes et méthylation de l’ADN selon une origine en écloserie ou dans le milieu naturel. Des différences d’expression persistent après la phase marine. L’association avec la méthylation reste faible : plusieurs mécanismes peuvent contribuer à ces signatures.
- La question
- Les signatures moléculaires associées à l’élevage précoce persistent-elles chez les adultes revenus se reproduire ?
- L’approche
- Comparaison de saumons coho adultes issus de deux systèmes fluviaux, par RNA-seq et séquençage bisulfite du génome entier.
- Ce que l’article apporte
- Les différences d’expression entre origines sont parallèles dans les deux rivières; leur lien avec la méthylation est limité.
- Les limites
- La méthylation n’explique qu’une faible part des différences d’expression observées ; d’autres mécanismes peuvent y contribuer. Ces signatures ne mesurent pas directement la performance des poissons en milieu naturel.
Figures de l’article
Les figures de cet article ne sont pas reproduites ici ; elles sont consultables dans l’article publié.
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