Une information présente dans le milieu
L’ADN environnemental désigne l’ADN étudié à partir d’échantillons prélevés dans un milieu. Nous l’étudions dans l’eau, les sols, les sédiments et les biofilms pour identifier les espèces et répondre aux questions de suivi.
La question détermine l’approche
Inventorier une communauté et rechercher une espèce précise ne conduisent pas au même choix d’analyse. Métabarcoding, métagénomique, dPCR ou longues lectures : chaque approche répond à un type de question.
Penser toute la chaîne
La conception, l’échantillonnage, les analyses moléculaires, le séquençage et la bioinformatique sont liés. L’interprétation doit revenir à la question initiale et au contexte du milieu étudié.