LDgenX

Explorer LDgenX

Demander un devis

Evolutionary Applications · 2017 · mis en ligne le 27 octobre 2016

Ancestry and adaptive evolution of anadromous, resident, and adfluvial rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in the San Francisco bay area: application of adaptive genomic variation to conservation in a highly impacted landscape

Leitwein M, Garza JC, Pearse DE

Dans la baie de San Francisco, les auteurs comparent l’ascendance et la variation adaptative de populations de truite arc-en-ciel vivant de part et d’autre d’obstacles à la migration. Les résultats relient contexte écologique, histoire des populations et traits migratoires, avec des implications pour la restauration des habitats.

La question
Comment les obstacles et les nouveaux habitats sont-ils associés aux différences génomiques de populations migratrices ou résidentes ?
L’approche
Comparaisons de structure génétique, d’ascendance et de variants associés à des traits migratoires dans plusieurs bassins versants.
Ce que l’article apporte
Des différences adaptatives accompagnent les contextes situés en amont et en aval des barrages; les populations conservent une ascendance côtière native.
Les limites
Les conclusions portent sur les populations étudiées autour de la baie de San Francisco ; elles ne prouvent pas l’effet de chaque aménagement ailleurs.

Figures de l’article

Figure 1, Ancestry and adaptive evolution of anadromous, resident, and adfluvial rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in the San Francisco bay area: application of adaptive genomic variation to conservation in a highly impacted landscapeFigure (nouvel onglet)
Figure 1. Map showing locations of population samples around San Francisco Bay. Sample sites are indicated by numbered triangles, and migration barriers are shown by bars, with sites above reservoir‐forming dams indicated by dots with size proportional to reservoir volume.Légende originale (en anglais). Leitwein M, Garza JC, Pearse DE (2017), Evolutionary Applications. CC BY 4.0
Figure 3, Ancestry and adaptive evolution of anadromous, resident, and adfluvial rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in the San Francisco bay area: application of adaptive genomic variation to conservation in a highly impacted landscapeFigure (nouvel onglet)
Figure 3. Principal component analysis showing relative genetic distances between individuals with coastal, San Francisco(SF) Bay Area, Central Valley, and hatchery trout strain ancestryLégende originale (en anglais). Leitwein M, Garza JC, Pearse DE (2017), Evolutionary Applications. CC BY 4.0

Parlons de votre projet

Votre question. Notre prochain point de départ.

Un projet en biodiversité, génomique ou bioinformatique ? Décrivez votre besoin pour recevoir une proposition, ou réservez un premier échange avec notre équipe scientifique.

Ou écrivez-nous : info@ldgenx.fr