L’équipe scientifique
Dr Emilie Delpuech
À la croisée des sciences du vivant et de l’informatique, Emilie développe des approches d’analyse de données omiques. Son parcours en génétique animale et en sélection génomique nourrit les analyses spécifiques aux projets.
Parcours
Passionnée par le vivant et par son étude, j’ai consacré une grande partie de mon parcours académique à apprendre les spécificités de la biologie végétale et animale.
Au vu de l’avancée des méthodes d’analyse des données biologiques, je me suis spécialisée en bioinformatique. Aujourd’hui, j’ai donc les connaissances pour analyser différents jeux de données dits omiques.
Grâce à ma double formation en sciences du vivant et en informatique, j’ai la capacité de m’intégrer dans divers projets de biologie, me permettant ainsi de mettre en place la meilleure approche bioinformatique possible pour la question posée. Dans le cadre de mes analyses, j’utilise différents types de langages informatiques pour construire des pipelines d’analyses afin de répondre à des questions biologiques.
Durant ma thèse et mes deux post-doctorats, je me suis impliquée dans des sujets de génétique animale afin d’améliorer la sélection génomique d’espèces d’élevage à partir de données génétiques et phénotypiques.
Je mets donc au service de LDgenX toutes mes connaissances en développement informatique afin de réaliser les analyses les plus spécifiques au sujet d’étude.
Publications
8 publications
- Quantitative genetics and GWAS reveal population-specific sex-ratio responses in wild European seabass (Dicentrarchus labrax) under various temperature scenariosLire la synthèse
- Larval survival in European seabass (Dicentrarchus labrax) is shaped by the natural thermal regime of their population of origin and the level of introgression of Atlantic and Mediterranean genomesLire la synthèse
- Chromosome-scale genome sequences of two Charadriiformes species: Scolopax rusticola and Lymnocryptes minimusLire la synthèse
- Genomic selection for individual feed efficiency in the European seabass: Response to selection on efficiency, commercial traits and sexLire la synthèse
- The Fate of a Polygenic Phenotype Within the Genomic Landscapes of Introgression in the European Seabass Hybrid ZoneLire la synthèse
- Whole-genome sequencing identifies interferon-induced protein IFI6/IFI27-like as a strong candidate gene for VNN resistance in European sea bassLire la synthèse
- Identification of genomic regions affecting production traits in pigs divergently selected for feed efficiencyLire la synthèse
- The impact of training on data from genetically-related lines on the accuracy of genomic predictions for feed efficiency traits in pigsLire la synthèse
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