Biodiversity Genomes · 2025
Chromosome-scale genome sequences of two Charadriiformes species: Scolopax rusticola and Lymnocryptes minimus
Les auteurs présentent des assemblages de génome de haute qualité pour deux limicoles, la bécasse des bois et la bécassine sourde. Le séquençage Illumina et Nanopore d’échantillons de sang frais, puis l’intégration de données Hi-C, permettent de reconstituer les chromosomes ; les données sont publiques dans GenBank.
- La question
- Peut-on disposer de génomes de référence complets pour la bécasse des bois et la bécassine sourde ?
- L’approche
- Séquençage Illumina et Nanopore de sang frais prélevé sur des oiseaux sauvages, assemblage de novo, puis intégration de données Hi-C pour reconstituer la structure des chromosomes.
- Ce que l’article apporte
- Deux assemblages de haute qualité, à l’échelle des chromosomes ; les lectures brutes et les assemblages sont disponibles dans GenBank.
- Les limites
- Article de ressource : il fournit des génomes de référence pour de futures études, sans analyse des populations à ce stade.
Figures de l’article
Les figures de cet article ne sont pas reproduites ici ; elles sont consultables dans l’article publié.
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